预测蛋白质的三维结构是解开生命奥秘的关键RoseTTAFold应运而生,作为一款基于深度学习模型的强大工具,它不仅能够精确地预测蛋白质结构,还能推断蛋白质之间的相互作用,这一切都得益于其创新的三轨网络架构

——背景——AlphaFold2于2025-05-11的CASP14蛋白质结构预测比赛上以绝对的优势夺冠,并且极大推进了该领域的发展而最近,借助AlphaFold2开发者——DeepMind团队提供的有限信息,David Baker课题组结合自己深刻的理解开发出了蛋白质结构预测方法RoseTTAFold,并且取得了接近AlphaFold2的效果。

RoseTTAFold是预测蛋白质结构的工具,与Alphafold2齐名首先, rosettaexe 是Rosetta软件的可执行文件,用户可以在安装完成后通过这个文件启动@在线客服工作时间 8:30-

尽管近年来在蛋白质结构预测方面取得了显著进展,但预测没有同源已知复合体的蛋白质-核酸复合体的结构仍是一个基本未解决的问题在这里,作者将RoseTTAFold机器学习蛋白结构预测方法扩展应用,以预测核酸和蛋白质-核酸复合体

尤其在生物和医学领域,人工智能技术可以说大放异彩,极大加速了有关生物、病理等科学的发展,而其中一项重要的应用,就是预测蛋白质结构。2020

尤其是AlphaFold2,预测的准确性只能用 卓越 来描述,在CASP 14大赛中一骑绝尘硬盘空间:RoseTTAFold包含三个超大数据库,需下载432G,解压后≈26T,一般的笔记本是顶不住的。 理想状态,需要配置完全匹配的conda、CUDA、Tensorflow-gpu、pyRosetta环境,这对于结构预测老手不是啥难事儿,但对 还菜还爱玩儿 青铜玩家就太复杂了,比如我。而且,使用win10的linux子系统,几乎无法按要求完成CUDA配置,因此我的GPU根本

在这个充满活力的领域中,一个引人注目的突破是RoseTTA-fold,它代表着蛋白质结构预测领域的一项重大进展RoseTTA-fold是一种基于人工智能的

结论:尝鲜失败,螃蟹不好吃,目前Alphafold2很RoseTTAFold都是针对人源,微生物源的还需后续数据的扩充才能使得上,笔主也在尝试里面的其他选项,奈何大家都想尝鲜,要排好久队呀(一周才能拿到结果)最后编辑于:20210728 :点击蓝字直达官网首页点击Submit:第一次需要注册,后面登入即可点击Queque:点击Example::查看例子预测后的页面长啥样的

DrugAI全文2025年05月11日,华盛顿大学蛋白设计研究所David Baker教授课题组及其他合作机构在Science上发表论文 Accurate prediction of protein structures and interactions using a three-track neural network ,公布了其开源蛋白质预测工具RoseTTAFold的研为了提高结构生物学研究的蛋白质结构预测准确性和推进蛋白质设计,研究人员探索了包含这五种特性的不同组合的网络架构。在没有公开的方法的情况下,研究人员尝试了多

后者只需要运行pyrosetta 版本(run_pyrosetta_)fasta文件或者fa文件(两个是一样的),这里是只是输出下面这种形式,在RoseTTAFold和alphafold中的输入形式是一样的数据分析作业:Protein prediction蛋白质预测,数据分析期末作业